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在一线生产中，有养殖人把一切希望寄于调水和培养菌藻上，不论时机，不分情况，动不动就调水培藻养菌，甚者象被洗脑似的一年到头都在往塘头一股脑的下这样菌放那种藻的，有必要吗？有时是需要的，但有时是无用的，甚至稍不注意还会把一塘好水搞得稀烂。
许多养殖户对有益微生物制剂一知半解，或推广宣传、进群听课受夸大、神话"效果"的影响，简单地认为使用有益微生物制剂，只要向塘中泼洒、倒下去即可，不管是什么菌种的制剂，有何使用要求等等，一概不讲究，有时是不知，使用上存在着很普遍的盲目性问题。各种水环境因子都可能对微生态制剂产生一定的影响，我们应把不良因素的影响降到最小，选择适宜的水环境来投用，其效果不但好而且是加倍的好。
其实，微生态制剂的使用也是有条件的，无论是芽孢杆菌还是光合细菌，等等，都是需要特定的生活环境的细菌，与其它成千上万种细菌一样，只有在能满足其生理特性需求的环境中才能正常地繁殖与生长，才能发挥其有限的作用。相反，如果将这些微生态制剂随意地泼洒在塘中，将有可能导致这些塘中固有的微生态群落结构发生改变，甚至引起池塘微生态群落多样性的消失，而这是非常有害的。
菌藻都要有一个最佳pH值的范围，过大的pH值波动会影响微生物制剂效果。比如硝化细菌，虽然各种亚硝酸细菌和硝酸细菌生长的最适pH值不同，但它们都在微碱性反应的环境中才能良好地生长，才能很好的发挥作用，如果水体pH值偏酸，使用硝化细菌等于白用。
天气好坏也会影响到藻类的繁殖和水色变化，大多数微生物制剂在20～30℃内有比较好的活性，水温10℃以下时活性明显降低，在使用微生物制剂时，要注意水温对产品效果的影响。有些厂家胡乱鼓动人们在低温时节使用微生物制剂，可以说是严重不负责任的表现，非常令人遗憾！
不同的微生态制剂，有着不同的生物学特征，要想把微生态制剂的效果发挥到极致，最起码的要求是：pH值6-8，水温15℃以上，水体溶解氧3毫克/升以上。另外，在计划使用硝化细菌和光合细菌时，两者并不适合同时投放在同一养殖塘中，因为它们相互有抑制作用，会降低其使用效果。
在养殖水体和水生动物无异常时，尽量不投入或少投用药物(含制剂)入塘，尽量维持现有的自然平衡状态，不要动不动就大量投用药物和生物制剂，花了钱不一定就有好的回报。有些东西入水后还有可能"按下葫芦起了瓢"，任何调水、改水、促藻、培菌的东西，虽然有利但也有弊，某种情况下可能反而会破坏水体的自然生态系统，打破平衡，适得其反，如果不慎引起整个水体生物生态系统紊乱，后果不堪设想。即使在水体发生异常(比如水质恶化，蓝藻暴发等)时，应在判明水体系统出现何种的问题，对症施治也不能乱用乱整。
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