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底质恶化的主要因素
1、清塘不彻底，晒塘时间过短，清塘所使用的药物不当以及清塘所造成的过多药物残留等。
2、在养殖期间，有机质残留过多，底部缺氧，是底质恶化的最主要因素。残饵、粪便、生物尸体等有机质残留，使得生物耗氧和化学耗氧剧增，水体底部溶氧无法满足耗氧量，从而造成池塘底质缺氧，厌氧菌大量繁殖，分解底部有机质而产生大量有毒中间产物，如氨氮、亚硝酸盐、硫化氢、甲烷、有机酸等有害物质。这些有毒物对水产动物有很大的毒害作用，同时又会造成致病菌大量繁殖，缺氧浮头等。
3、大量频繁使用化学消毒剂、农药杀虫剂、杀藻剂等，从而破坏水体及底质自净能力。
不良底质
1、酸臭、腥臭底质
形成原因：池底腐败的有机质过多，主要是由于清塘不彻底、养殖过程投饵过剩、没有采取措施定期改良底质等，另外，增氧措施不足，又没有定期抛撒增氧剂，使得有机质没有得到充分氧化分解，产生大量有毒中间产物，如氨氮亚硝酸盐、硫化氢、甲烷等，严重时底质会产生大量有害气体，出现“冒泡”现象。
2、板结底质
形成原因：多次大量使用化肥肥水、过量使用硫酸铜杀虫杀藻剂、大量使用生石灰等药物，造成底质板结，底质与水体之间气体、营养元素的交换被阻隔，水环境缓冲能力减弱，水质变化无常，水产动物容易产生应激反应。
3、“泥皮”底质
形成原因：大量老化死亡藻类和悬浮胶体沉积物沉淀于底部，在微生物作用后，会变成浮皮、并在水体表面形成大量泡沫等。
4、“丝藻”底质
形成原因：底质与水体之间营养元素的交换被阻隔，致使水体营养元素的不平衡或缺乏，出现“倒藻”、“转水”（水质一夜之间变清），水质过瘦，清澈见底，底部丝状藻、青泥苔大量繁殖。
5、“浑浊”底质
形成原因：有机质残留过多，且得不到充分氧化分解，以胶体形式释放并悬浮于水体中，造成水质“浑浊”；或养殖密度过大，水产动物在底部不断骚动，引起水质“浑浊”；或因暴雨夹带大量粘土浆，引起水质“浑浊”。“浑浊”水质，悬浮沉降到底部，必然引起底质“浑浊”；另外，“浑浊”水质会遮蔽藻类光合作用，使水体自净能力减弱，使致病微生物大量繁殖，造成病害。
6、“偷死”底质
形成原因：由于底部长时期缺氧，致使氨氮、亚硝酸盐、硫化氢、甲烷、有机酸等有害物质累积过多，使水产动物于底部中毒死亡，收获时发现底部大量死亡残尸。
池塘底质改良方法
生产中多注重水体改良，有“看水养鱼”之说，而没有重视底层水是否低氧，底泥是否发臭，发黑。我们经常遇到的鱼类“浮头”或“泛池”，很多都是底质恶化的结果。如果底质好即使出现“下大雨”等异常天气，也不会造成溶氧的迅速降低或有害物质的迅速升高。我们知道溶氧低不仅造成养殖动物生存困难而且影响养殖动物摄食及消化率，还可造成水体中有害的还原性物质（氨氮、硫化物等）升高及致病细菌增多，从而影响水体的稳定及养殖动物的生长及抗病力等。因此底质修复和改良有重要意义。
1、物理方法
清塘挖淤一般在冬季或早春等生产闲季进行。大多采用先排干池水，然后用水力挖塘机组像开挖新塘一样清理淤泥。此法成本低、适应性强，但作业时需要有水源和较大的荒地或浅滩用于排放泥浆，让其沉淀。生产实践证明：鲢、鳙池底泥厚度在20cm～40cm；草、鲂、鲤鱼池底泥以10cm～15cm为宜。
因此，为保持良好水质，每隔1-2年应清除10cm～20cm呈暗黑色的底泥。池底再经过冰冻日晒（“冬干”），促进有机物质的分解，消灭病原体和其他有害生物。在此期间还可进行池塘的修整加固、堵塞漏洞、维修闸门和铲除杂草等工作。
2、化学方法
化学方法最常用的就是生石灰清塘。生石灰遇水后发生化学反应，放出大量的热能，中和淤泥中的各种有机酸，改变酸性环境，从而可以起到除害杀菌、施肥、改善底质和水质的作用。
使用时可干池清塘或带水清塘。带水清塘一般是在总碱度、总硬度及pH值都偏低的池塘，及时合理地施用石灰；而池水和底质中钙离子浓度较大、碱度较高，则不必施生石灰；在有机质贫乏的养殖塘不宜单施生石灰，否则会加剧有机物的分解，使有机物积存更少，池塘肥力进一步下降，恢复更为困难。
3、生物方法
利用生物来修复养殖塘底质，减少底质有机物的积累也能取得显著效果。据报道，在老化污染虾池中移植沙蚕等底栖生物，并培育成优势种群，可大量摄食虾池中的残饵、粪便以及其它生物尸体和有机碎屑，减缓了虾池底部有机物的积累。而且沙蚕营穴居生活,其刚毛的不断划动行成了一个个小的水流循环，能增加底质中的溶解氧。
光合细菌以及复合益生菌等微生物制剂也能对池塘底质进行改良。光合细菌可以在光线微弱、有机物、硫化氢等丰富的池底繁衍，并利用这些物质建造自身，而其本身又被其他动物捕食，构成了养殖塘中物质循环和食物链的重要环节。所以光合细菌特别是在池底污染严重或因水质不良又不能换水的封闭式养殖塘，可发挥出较明显的作用。复合型微生物底质改良剂，能发挥各菌种的协同作用，将残饵、排泄物、动植物尸体等影响底质变坏的隐患及时分解消除，不仅改善了底质和水质，而且控制了病原微生物及其病害的蔓延扩散。
4、其它：
淤泥沉积速度与施肥、投饵等饲养管理措施直接相关。在生产中努力做到看水施肥，切忌过量；按照生态互补原则合理混养、密养；投饲量根据季节、气候、生长情况和水环境变化灵活掌握；在饲料中添加诱食剂、促长剂等，增强水产动物的食欲，促进饲料营养的吸收转化，降低饵料系数，从源头上解决排泄物对底质和水质的污染；防治水草(特别是丝状藻)大量生长，及时捞出过多或死亡的水草，以防腐烂变质；有条件的可朝黑化区域泼撒炼铁炉渣(一般1.5kg/m3)，以延缓黑化过程，并降低危害。
另外，如果干池期较长，可考虑把水产养殖和农作物进行轮作。这样可以使淤泥更充分地干透，靠陆生作物发达的根系，使土壤充分与空气接触，有利于有机物的矿化分解，更好地改良池底，同时，还可以获得农作物本身的经济价值。另外，生长的青绿作物和牧草还可作为池塘的优良绿肥和鱼类的饲料。
池塘底质的缓冲能力、自净能力、生产性能、抗逆性能，是池塘养殖成败的关键。“成也底质、败也底质”对于池塘养殖业而言一点都不为过。要使池塘养殖业得以可持续发展，克服连作障碍，池塘底质定期改良需引起池塘养殖者们足够的重视。
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