在水产养殖过程中，药物使用较多的三大类，分别是消毒药、杀虫药、复合微生态制剂。这三种药物的使用往往要掌握技巧，才能达到理想的效果，同时搭配增氧机，效果事半功倍。
消毒药的使用养殖水体或多或少都存在光合细菌、固氮细菌、硝化细菌、藻类等。消毒药的使用，特别是水体的定期消毒，可以减少水中的病原微生物，对预防虾病发生起到良好的作用，但同时也会杀灭水中大部分自然界的有益微生物菌群；也会抑制水中藻类的生长繁殖。池塘水中溶解氧在晴天时有90％左右由浮游植物的光合作用来补充，水体中藻类的生长繁殖受到抑制，水中溶解氧会降低；水体中光合细菌、固氮细菌、硝化细菌等自然界微生物菌群减少，池塘中有害物质的生物分解会受到影响，引起水体溶解氧降低。
通过监测发现，使用消毒药后，如果不采取增氧措施，一天后，水体中溶解氧往往降低1毫克/升以上。南美白对虾养殖饲养密度高，水体溶解氧普遍在4-5毫克/升之间，一些养殖户在使用消毒药时，因养殖水体溶解氧偏低(4毫克/升以下)，用药后对水体的处理措施(主要是增氧措施)不当，在此之后的二天早晨往往出现泛塘或因连续几天溶解氧不足导致疾病发生。如果在用药前提高水体溶氧量，用药后二三天内采取增氧措施(特别是夜晚开增氧机或使用增氧剂)，再结合在用药后两天适当换水，可避免用药后出现的副作用。我们认为，在水体溶解氧不足的时候，施用消毒药前2-3小时开增氧机，使用消毒药后二三天内多开增氧机，特别是夜晚开增氧机，配合适当换水是使用消毒药前后应做的措施。尤其是高密度养殖，更应引起注意。
还有一类产生气体的消毒药，如二氧化氯消毒药，使用时要注意防止泛塘。二氧化氯制剂作为水产养殖第四代水体消毒药，其消毒效果很好，从理论上讲，它还可以通过降低水体中生物及化学耗氧量来提高水体中的溶氧量，但这类消毒药使用不当，引起泛塘或引发虾病发生的事例不在少数。我们认为，主要原因是池塘水位较深，水中透明度过低，水体形成氧债层，用药后产生的二氧化氯气体引起水体交流，造成底层有毒气体(硫化氢、甲烷等)全池扩散，引起全池缺氧；若导致水体溶解氧偏低可引发虾病或使疾病更加严重。所以，使用这类消毒药，一定要根据实际情况，施药前用增氧机打破水体氧债层，结合用药后一段长时间开增氧机，可避免用药后出现的副作用。
杀虫药的使用南美白对虾主要寄生虫病是虾类固着纤毛虫病，很多养殖户用福尔马林、硫酸铜等杀虫药来杀虫，这类药物对藻类的抑制或杀灭作用是很强的，水体中藻类生长繁殖受到抑制，水中溶解氧会降低；藻类死亡，其尸体的分解大量耗氧，加剧水体中溶解氧不足；而且这类药物有一定的毒性，会影响虾类的呼吸作用。所以使用这类药物后往往在之后的第二天早晨出现泛塘或引发疾病发生。
通过监测发现，使用这类药物后，二三天内水体中溶解氧降幅往往超过1毫克/升以上。我们认为，对虾类的固着纤毛虫病，不主张用杀虫药来杀虫，应考虑促使虾脱壳、勤换水、调节水体、pH值在8以上等措施来替代杀虫药。非用杀虫药不可，用药前后对水体的处理措施应按消毒药使用前后的处理措施去做，而且三天后要适当再培水，以恢复或促进藻类的生长繁殖。
光合细菌和复合微生态制剂的使用南美白对虾养殖，发病情况日趋严重。发生大范围虾病的池塘，往往发病前虾塘水色往往发黑或发红，经显微镜检查，发现有益藻类大量老化或死亡，有害藻类生长。
发病时养殖户往往使用大量光合细菌或复合微生态制剂去处理水质恶化问题，由于使用不当，用药后虾病更严重。特别是在阳光不足时(阴天或晚上)或水体中溶解氧不足时施用则更严重。光合细菌在黑暗情况下是通过有氧呼吸作用来获取能量，其载体本身富含有机物或无机物，不合理的大量使用，往往造成水体生物耗氧量和化学耗氧量增加，引起水体溶解氧不足而导致虾病更加严重。复合微生态制剂本身也有类似的增加水体生物耗氧量和化学耗氧量的作用。因此，使用这类制剂应在有阳光和采取增氧措施的前提下施用，才能避免施用这类制剂后出现的副作用。
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